General Information
| Course Code | X_435350 |
|---|---|
| Credits | 6 EC |
| Period | P4 |
| Course Level | 300 |
| Language of Tuition | Dutch |
| Faculty | Faculty of Science |
| Course Coordinator | prof. dr. C. Fonseca Guerra |
| Examiner | prof. dr. C. Fonseca Guerra |
| Teaching Staff |
prof. dr. C. Fonseca Guerra prof. dr. F.M. Bickelhaupt |
|
Part of programme(s)
Use the arrow keys to navigate the list, Enter to select, and Escape to close.
|
|
Practical Information
You need to register for this course yourself. The (de)registration deadlines can be found on VU.nl
| Teaching Methods | Practical, Lecture |
|---|
Target audiences
This course is also available as:
Course Objective
Het leren van moderne quantumchemische methoden en met name het toepassen daarvan bij het computerondersteund oplossen van farmaco-chemische en biochemische problemen.
Course Content
Computational chemistry is tegenwoordig onmisbaar binnen de ontwikkeling van nieuwe geneesmiddelen. Van het voorspellen hoe een medicijn bindt aan een receptor tot het begrijpen waarom een bepaalde stof wel of juist niet werkzaam is: computermodellen spelen een steeds grotere rol binnen de farmaceutische wetenschap. Met behulp van geavanceerde rekenmethoden kunnen moleculaire eigenschappen en interacties nauwkeurig worden onderzocht, vaak nog vóórdat een stof daadwerkelijk in het laboratorium wordt gesynthetiseerd. Dit bespaart tijd, kosten, grondstoffen én versnelt het proces van geneesmiddelontwikkeling.
In deze cursus maak je kennis met moderne computationele technieken en software die veel worden gebruikt binnen de farmaceutische en biomoleculaire chemie. Je leert werken met Density Functional Theory (DFT) (een quantumchemische methode). Deze methode wordt toegepast om moleculaire structuren te voorspellen, interacties tussen geneesmiddelen en biomoleculen te analyseren en reactieprofielen en energielandschappen in kaart te brengen.
Daarnaast leer je hoe farmaceutische en (bio)chemische vraagstukken vertaald kunnen worden naar een computationeel model. Je ontwikkelt vaardigheden om berekende resultaten kritisch te interpreteren en te koppelen aan moleculaire en elektronische structuren.
Een belangrijk aspect van de cursus is dat computational chemistry een verbindende rol speelt tussen verschillende disciplines binnen de farmaceutische wetenschappen. Dezelfde computationele methoden kunnen worden toegepast op uiteenlopende vraagstukken binnen organische chemie, analytsiche chemie, medicinale chemie, farmacochemie, en biochemie. Daarmee vormt computational chemistry een krachtige tool binnen modern farmaceutisch onderzoek.
Additional Information Teaching Methods
De cursus bestaat uit hoorcolleges en hands-on computer labs.
Method of Assessment
Tentamen en practicum (verslagen).Literature
Christopher J. Cramer, "Essentials of Computational Chemistry", 2nd Edition, John Wiley & Sons, 2004 (ISBN 0-470-09182-7)
Additional Information Target Audience
3F, 3MNW
Additional Information
Binnen dit vak mag generatieve AI (GenAI), zoals ChatGPT of vergelijkbare tools, uitsluitend worden gebruikt voor oriëntatie en brainstorm, bijvoorbeeld om ideeën te verkennen of vragen te verhelderen. GenAI mag niet worden gebruikt voor het genereren van inhoud die onderdeel wordt van het ingeleverde werk. Het eindproduct moet volledig berusten op eigen inzicht, analyse en formulering. Onjuist gebruik van GenAI wordt beschouwd als fraude. Bij constatering hiervan wordt het ingeleverde werk of toetsresultaat ongeldig verklaard en kan de examencommissie verdere maatregelen nemen.