Computational (Pharmaco)Chemistry

2026-2027

Algemene informatie

Vakcode X_435350
Studiepunten 6 EC
Periode P4
Vakniveau 300
Onderwijstaal Nederlands
Faculteit Faculteit der Bètawetenschappen
Vakcoördinator prof. dr. C. Fonseca Guerra
Examinator prof. dr. C. Fonseca Guerra
Docenten prof. dr. C. Fonseca Guerra
prof. dr. F.M. Bickelhaupt
Onderdeel van opleiding(en)

Praktische informatie

Voor dit vak moet je zelf intekenen. De inteken- en afmeldtermijnen staan op VU.nl

Onderwijsvorm Practicum, Hoorcollege

Doelgroepen

Dit vak is ook toegankelijk als:

Doel vak

Het leren van moderne quantumchemische methoden en met name het toepassen daarvan bij het computerondersteund oplossen van farmaco-chemische en biochemische problemen.

Inhoud vak

Computational chemistry is tegenwoordig onmisbaar binnen de ontwikkeling van nieuwe geneesmiddelen. Van het voorspellen hoe een medicijn bindt aan een receptor tot het begrijpen waarom een bepaalde stof wel of juist niet werkzaam is: computermodellen spelen een steeds grotere rol binnen de farmaceutische wetenschap. Met behulp van geavanceerde rekenmethoden kunnen moleculaire eigenschappen en interacties nauwkeurig worden onderzocht, vaak nog vóórdat een stof daadwerkelijk in het laboratorium wordt gesynthetiseerd. Dit bespaart tijd, kosten, grondstoffen én versnelt het proces van geneesmiddelontwikkeling.

In deze cursus maak je kennis met moderne computationele technieken en software die veel worden gebruikt binnen de farmaceutische en biomoleculaire chemie. Je leert werken met Density Functional Theory (DFT) (een quantumchemische methode). Deze methode wordt toegepast om moleculaire structuren te voorspellen, interacties tussen geneesmiddelen en biomoleculen te analyseren en reactieprofielen en energielandschappen in kaart te brengen.

Daarnaast leer je hoe farmaceutische en (bio)chemische vraagstukken vertaald kunnen worden naar een computationeel model. Je ontwikkelt vaardigheden om berekende resultaten kritisch te interpreteren en te koppelen aan moleculaire en elektronische structuren.

Een belangrijk aspect van de cursus is dat computational chemistry een verbindende rol speelt tussen verschillende disciplines binnen de farmaceutische wetenschappen. Dezelfde computationele methoden kunnen worden toegepast op uiteenlopende vraagstukken binnen organische chemie, analytsiche chemie, medicinale chemie, farmacochemie, en biochemie. Daarmee vormt computational chemistry een krachtige tool binnen modern farmaceutisch onderzoek.

Aanvullende informatie onderwijsvormen

De cursus bestaat uit hoorcolleges en hands-on computer labs.

Toetsvorm

Tentamen en practicum (verslagen).

Literatuur

Christopher J. Cramer, "Essentials of Computational Chemistry", 2nd Edition, John Wiley & Sons, 2004 (ISBN 0-470-09182-7)

Aanvullende informatie doelgroep

3F, 3MNW

Overige informatie

Binnen dit vak mag generatieve AI (GenAI), zoals ChatGPT of vergelijkbare tools, uitsluitend worden gebruikt voor oriëntatie en brainstorm, bijvoorbeeld om ideeën te verkennen of vragen te verhelderen. GenAI mag niet worden gebruikt voor het genereren van inhoud die onderdeel wordt van het ingeleverde werk. Het eindproduct moet volledig berusten op eigen inzicht, analyse en formulering. Onjuist gebruik van GenAI wordt beschouwd als fraude. Bij constatering hiervan wordt het ingeleverde werk of toetsresultaat ongeldig verklaard en kan de examencommissie verdere maatregelen nemen.

Aanbevolen voorkennis

Thermodynamica en Organische Chemie