Computational (Pharmaco)Chemistry

Doel vak

Het leren van moderne quantumchemische methoden en met name het toepassen daarvan bij het computerondersteund oplossen van farmaco-chemische problemen.

Inhoud vak

Computational chemistry is niet meer weg te denken uit de moderne scheikunde en farmacochemie. Tal van moleculaire eigenschappen kunnen met chemische nauwkeurigheid berekend worden, waardoor experimenteel moeilijk of niet te achterhalen grootheden alsnog bestudeerd of voorspeld kunnen worden.
De experimentator kan hierdoor veel gerichter te werk gaan en het beoogde doel sneller, met minder kosten en een lager verbruik aan grondstoffen en energie bereiken.

Eén van de hoofddoelen van de cursus is het leren van en werken met state-of-the-art quantumchemische en moleculair mechanische methoden en computersoftware. Hierbij komen de traditionele ab initio-methode (Hartree-Fock) en dichtheidsfunctionaaltheorie (DFT) aan de orde. Deze worden onder meer toegepast op het voorspellen van structuren en het verkennen van potentiaaloppervlakken (bijv. t.b.v. het verkrijgen van reactieprofielen).

Een tweede hoofddoel is het verkrijgen van de vaardigheid (experimenteel) farmaco-chemische problemen te vertalen naar een computationele aanpak, die tot een praktische oplossing leidt. Er zal voorts een begin worden gemaakt met het interpreteren van berekende resultaten in termen van modellen van de elektronische structuur. Een wezenlijk punt in deze cursus is het unificerende karakter van computational chemistry: dezelfde theoretische methoden dienen als gereedschap voor het oplossen van diverse vraagstukken uit alle gebieden van de scheikunde, van theoretische en organische chemie tot farmaco- en biochemie.

Aanvullende informatie onderwijsvormen

Toetsvorm

Literatuur

Christopher J. Cramer, "Essentials of Computational Chemistry", 2nd Edition, John Wiley & Sons, 2004 (ISBN 0-470-09182-7)

Aanvullende informatie doelgroep

Aanbevolen voorkennis